Comparaison de 15 versions de la 65^e nouvelle de l'Heptaméron de Marguerite de Navarre avec CollateX

À partir du corpus décrit dans ce diaporama, ont été construits :

• un graphe d'alignement et un tableau d'alignement avec CollateX ;
• le tableau d'alignement avec CollateX peut s'adapter à la largeur de la fenêtre du navigateur (sur la page) : version dynamique (version statique de 1000 pixels de largeur) ;
• le résultat de l'alignement réalisé par MAFFT et visualisé par GeneDoc (fichier MSF source, fichier FASTA obtenu par MAFFT).

Tutoriel pour l'utilisation de MAFFT sur des textes littéraires

• formatage des fichiers : remplacer tous les signes de ponctuation par -, les -- par -, les - par ?, les é par e, à par a, etc., pour obtenir des textes contenant uniquement des mots constitués de caractères de a à z et séparés par un ? ;
• pour obtenir un fichier d'entrée pour MAFFT : 1) chargement de chaque fichier ainsi formaté dans GeneDoc (menu "File", "New" puis "File", "Import", puis sélectionner le type "Text" puis cliquer sur "Import" pour chaque fichier texte chargé, puis enfin sur "Done") ; 2) sauvegarde du fichier combinant tous les fichiers, au format MSF, multiple sequence file (menu "File", "Save as...") : obtention du fichier Heptameron.msf ;
• envoi de ce fichier dans la version web de MAFFT (output format : "Pearson/FASTA", "More options" → "Matrix" : "NONE") ;
• télécharger le fichier FASTA résultat, y rechercher/remplacer les X majuscules par _ ;
• ouvrir le fichier FASTA ainsi modifié dans GeneDoc par le menu "File", "Import" ;
• imprimer en PDF depuis GeneDoc (menu "File", "Print") pour obtenir ce PDF.